| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D5433 | 南京 | 08:07 | 南京 | 08:07 | 南通 | 10:48 | 启东 | 11:38 |
| D5436 | 南京 | 08:07 | 南京 | 08:07 | 南通 | 10:48 | 启东 | 11:38 |
| D5421 | 南京 | 08:50 | 南京 | 08:50 | 南通 | 11:25 | 启东 | 12:26 |
| D5424 | 南京 | 08:50 | 南京 | 08:50 | 南通 | 11:25 | 启东 | 12:26 |
| D5425 | 南京 | 12:53 | 南京 | 12:53 | 南通 | 15:21 | 启东 | 16:08 |
| D5428 | 南京 | 12:53 | 南京 | 12:53 | 南通 | 15:21 | 启东 | 16:08 |
| D5437 | 南京 | 15:46 | 南京 | 15:46 | 南通 | 18:17 | 启东 | 19:09 |
| D5440 | 南京 | 15:46 | 南京 | 15:46 | 南通 | 18:17 | 启东 | 19:09 |
| D9485 | 南京 | 16:45 | 南京 | 16:45 | 南通 | 19:23 | 南通 | 19:23 |
| D9488 | 南京 | 16:45 | 南京 | 16:45 | 南通 | 19:23 | 南通 | 19:23 |
| D5429 | 南京 | 18:12 | 南京 | 18:12 | 南通 | 20:52 | 启东 | 21:46 |
| D5432 | 南京 | 18:12 | 南京 | 18:12 | 南通 | 20:52 | 启东 | 21:46 |